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新疆农业科学院农业部荒漠绿洲作物生理生态与耕作重点实验室的依托单位为新疆农业科学院。重点实验室的主要任务是：在荒漠绿洲区域独特的生态条件下，针对作物生理生态与耕作学科建设和区域发展的科技需求，以应用基础和应用技术研究为主，重点开展荒漠绿洲作物产量品质的生理生态机制、水肥高效利用的栽培学机理、逆境生物学及关键过程调控、作物产量潜力与资源优化、农田生态与可持续耕作制度研究，形成荒漠绿洲作物高产、优质、高效、生态、安全协调的耕作栽培理论技术体系，为区域农业发展提供新技术和新产品，聚集和培养高水平的科技人才，指导科学观测实验站建设和运行，积极组织开展学术交流活动。
根据新疆主要农作物(小麦、棉花、玉米和果蔬等)生产现状与科技发展需求，重点实验室研究方向为：1.荒漠绿洲作物产量品质形成的生理生态基础及其调控。重点开展小麦、棉花、玉米等作物在不同农田生态条件下产量和品质形成规律、生态环境条件对作物产量和品质形成的生态机制，以及作物器官建成与功能调控、个体与群体发育特点及其调控机制研究。2. 荒漠绿洲作物水肥高效利用的栽培学机理与综合管理技术研究。重点开展小麦、棉花、玉米等作物产量和品质形成与主要营养元素的互作关系研究，从生态学角度研究作物的养分综合管理技术、高效利用水分的机制及节水灌溉制度和技术，形成资源高效与环境友好的水肥高效利用综合管理技术体系并应用于生产。3.荒漠绿洲作物逆境生物学及其抗逆关键技术调控。针对荒漠绿洲地区频发高温热害、低温冷害、干旱、盐碱等主要灾害和隐性灾害，重点开展小麦、玉米、棉花等作物对主要胁迫的响应，以及非生物逆境对作物生产影响的内在机制研究，引进和发掘抗逆种质资源，筛选抗逆性品种，提出各类灾害的防御技术及灾后补救措施构，建立作物抗灾减灾集成技术体系并应用于生产。4. 荒漠绿洲作物高产、优质、高效、安全栽培理论与技术研究。重点开展小麦、棉花、玉米等主要农作物产量潜力、生物学特性、生理基础，影响作物高产、高效和品质形成的关键制约因素及作物温光水肥等资源的优化配置、产量品质形成过程资源高效利用机理和调控途径研究，研究集成主要农作物新品种高产、优质、高效、生态、安全生产技术并推广应用。5. 荒漠绿洲农田生态与可持续耕作制度研究。重点开展不同区域农田资源高效利用与管理，作物区域布局与资源优化、农田高效种植模式、保护性耕作栽培技术、粮棉果间作资源经济高效利用模式研究、高光效作物种质资源的引进、筛选、应用，友好高效利用...
