期刊:中国农业大学学报 ISSN:1007-4333 , 年:2015 . 卷:20 . 期:1   页码:37-49

摘要

通过正交试验设计,比较苦荞序列相关多态性-聚合酶链式反应(Sequence related amplified polymorphism-polymerase chain reaction,SRAP-PCR)扩增反应体系的组合,选出最佳扩增体系用于苦荞SRAP分子标记进行遗传多样性分析。其中最佳SRAP-PCR反应扩增体系为Taq DNA聚合酶2 U、Mg~(2+) 1. 5 mmol/L、DNA模板75 ng、引物0.5 μmol/L。从238对SRAP引物组合中筛选出20对多态性较高的引物组合,并对15个苦荞品种进行遗传多样性分析。结果表明:20对引物组合共扩增出128个位点,其多态性信息量(Polymorphism information content,PIC)值在0. 66~0. 95,每对引物组合扩增位点为7~13个,多态性比率平均值为81. 6%,其中多态性信息量值为0. 95的引物组合为me7em11、me9em4和me12em8。基于UPGMA法聚类(GS=0. 78)可将15个苦荞品种划分为3大类,但这3类划分的品种没有明显的地域分布特征。

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关键词
苦荞;  SRAP-PCR;  正交试验设计;  遗传多样性

作者信息

作者机构:
     [1] [ 令狐斌;  侯思宇;  孙朝霞;  黄可盛;  路阳;  韩渊怀;  许冬梅 ︾ ]  山西农业大学农学院