谷子TCP 基因家族成员序列特征及表达模式分析
期刊:分子植物育种 ISSN:1672-416X , 年:2020 . 卷:18 . 期:3 页码:710-718
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- 摘要
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为深入解析谷子TCP基因家族的功能,通过生物信息学方法对谷子TCP转录因子家族基因成员序列特征、基因结构、染色体定位、系统进化关系及表达模式进行分析。结果表明:除第8染色体之外,从谷子基因组上其余8条染色体中共鉴定出26个TCP家族成员,并根据其在染色体的顺序和位置先后进行命名,其中分布在第3和第5染色体上的TCP家族成员数量最多,高达5个。不同家族成员其编码的氨基酸残基数目具有明显差异,范围为95 aa~451 aa。其中SiTCP21基因编码氨基酸残基数目最少为95个氨基酸;而SiTCP15最多为451个氨基酸残基。26个TCP家族成员的蛋白结构中均含有bHLH保守结构域。基因表达分析结果表明,31%的成员在穗中的表达量明显高于其他组织,因此推测该基因家族可能对谷子穗部生长发育的调控起关键作用。本研究对深入研究SiTCPs家族基因的功能奠定了基础,也为谷子生长发育的调控机制提供了新的思路。
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关键词
谷子(Setaria italica); TCP; 转录因子; 生物信息学分析; 基因表达分析
- 作者信息
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作者机构:
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连卜颍; 王喆; 韩尚玲 ]
山西农业大学农学院;;山西农业大学,农业生物工程研究所
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侯思宇; 韩渊怀; 李红英 ]
山西农业大学农学院;;山西农业大学,农业生物工程研究所;;山西农业大学